Le operazioni di estrazione e immobilizzazione dei rifiutisaranno svolte all'interno di una struttura di confinamento, con caratteristiche di isolamento sia statico che dinamico.,
L'estrazione dei rifiuti liquidi organici avverrà attraverso un sistema di aspirazione che consentirà il passaggio dal serbatoio ai fusti dove il liquido sarà stabilizzato attraverso speciali polimeri assorbenti.
I fusti saranno quindi stoccati in container all'interno di un'apposita area del sito prima del loro invio all'operatore estero.
I manufatti finali rientreranno nell'impianto Eurex dove saranno stoccati in vista del loro conferimento finale al Deposito Nazionale.
Nel 2025 è iniziata la realizzazione dell'impianto di estrazione dei rifiuti e loro immobilizzazione; la consegna dell'impianto al Sito è prevista nel 2026.
Per la gestione dei rifiuti organici, gli impianti di trattamento devono soddisfare alcune prescrizioni normative relative ai materiali contenenti plutonio. Nel 2025 è stata pubblicata una nuova manifestazione di interesse al fine di individuare gli operatori economici internazionali che abbiano le capacità tecniche e gestionali allineate alle prescrizioni normative internazionali, ciò, allo scopo di indire un ulteriore bando di gara per l'affidamento del servizio di trattamento dei rifiuti organici.